As áreas de pesquisas desenvolvimento e inovação, ou seja, os Centros de Execução de Projetos do PTI-BR, também contam com parcerias com universidades e grandes empresas, sempre objetivando a busca por soluções inovadoras para transformar conhecimentos e tecnologias em soluções para o progresso da sociedade. Por meio de seus especialistas de alto nível, os Centros produzem pesquisas e experimentos tecnológicos em observância às demandas do mercado, sempre inovadores, funcionais, eficientes e que atendam às necessidades dos clientes.
Atualmente há 7 (sete) Centros de Execução de Projetos no Parque Tecnológico Itaipu, sendo eles: Automação e Simulação de Sistemas Elétricos, Energias Renováveis, Estrutura de Barragens, Inteligência e Gestão Territorial, Segurança Cibernética, Tecnologias Abertas e IoT e Ciência e Educação. Todos atuando para diversificar a receita da Fundação PTI-BR, por meio da venda de Serviços Técnicos Tecnológicos e execução de Projetos de P&D+I,  promovendo a integração com os parceiros do ecossistema de inovação, para fins de transferência de conhecimento.
Os Centros de Execução atuam com projetos de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação (P&D+I), além de sediar em seu condomínio o CIBIogás – Centro Internacional de Energias Renováveis e o ITAI – Instituto de Tecnologia Aplicada e Inovação.